次世代シーケンシング

インプランタでは全ゲノムde novoシーケンス解析、全ゲノムリシーケンス解析をはじめとして、目的に応じた次世代シーケンシングメニューをご用意しています。

 

植物試料からのゲノムDNA抽出及び品質チェックも承っております。
下記のサービスフローをご参照ください。

 

 

 

  • 全ゲノムde novoシーケンス解析

     

    これまでにリファレンスシーケンスのない、未知のゲノム解析を行います。

     

    シーケンスプラットフォームとシーケンスリード長、ペア-エンド 及びメイト-エンドライブラリーオプションとの組み合わせにより、様々な生物の全ゲノム解析を可能にします。植物ではシロイヌナズナ、ビーツ、ゴムの木、パルムオイル、ブドウ、野菜類等、豊富な経験があります。微生物ゲノムの解析も承っております。

     

    使用可能なプラットフォーム

    Illumina HiSeq2000 / HiSeq2500 / MiSeq

    454 GS-FLX / Plus

     

    Data Analysis

    De novo Assembly

    Gene Prediction

    Variant Calling (SNP, In/Dels)

    Gene Annotation

    Customized Analysis

     

  • 全ゲノムリシーケンス解析

     

    既にリファレンスシーケンスのあるものについて全ゲノムリシーケンス解析を行います。

     

    変異体の解析、2つの品種間の比較、遺伝子マッピング等に、幅広くご利用いただけます。SNP解析等データ解析も承っております。

     

    使用可能なプラットフォーム

    Illumina HiSeq2000 / HiSeq2500 / MiSeq

    454 GS-FLX / Plus

     

    Data Analysis

    Alignment and summary of data production

    Variant Calling (SNP, In/Del) and Annotation

    Structural Variation (CNV and SV) and Annotation

    Comparative Analysis

    Customized Analysis

     

サービスフロー

(青色がお客様の作業になります)

ご依頼内容の打ち合わせ

*御見積やサンプル情報をご連絡いたします

ご発注

gDNAをご送付の場合

gDNAの抽出から弊社が行う場合

サンプル及び
オーダーシートをお送りください

まずはsmall-scaleで収量等の
確認を行います

試験用のサンプルをご提供ください









small-scaleで抽出、収量の確認

small-scaleでの結果から必要サンプル量等をご相談させていただきます

本サンプルをご提供ください

large-scaleで必要量の抽出

サンプルの品質確認

*gDNAをご送付頂いた場合の品質確認は3回まで無料で行います

品質確認レポートのご報告

*品質確認の結果から、解析に進めるかをご相談させていただきます

解析開始

解析結果の納品

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